Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
RETNLBQ9BQ08 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
RETNLBQ9BQ08 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms