Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID3AQ99856 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID3AQ99856 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID3AQ99856 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms