Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
EIF3CQ99613 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
EIF3CQ99613 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms