Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
EYA3Q99504 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EYA3Q99504 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
EYA3Q99504 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms