Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CSRNP1Q96S65 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CSRNP1Q96S65 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CSRNP1Q96S65 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms