Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GCNAQ96QF7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GCNAQ96QF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms