Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP8

GBP5, Guanylate-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP5Q96PP8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GBP5Q96PP8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GBP5Q96PP8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms