Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP4

TSGA13, Testis-specific gene 13 protein, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA13Q96PP4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSGA13Q96PP4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSGA13Q96PP4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms