Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE7

MCEE, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCEEQ96PE7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCEEQ96PE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCEEQ96PE7 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms