Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCLT1Q96NL6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCLT1Q96NL6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms