Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA8

TSNARE1, t-SNARE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1Q96NA8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TSNARE1Q96NA8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TSNARE1Q96NA8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms