Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf85Q96MD7 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C9orf85Q96MD7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms