Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CCDC7Q96M83 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CCDC7Q96M83 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC7Q96M83 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms