Protein–RNA interactions for Protein: Q96L03

SPATA17, Spermatogenesis-associated protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA17Q96L03 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPATA17Q96L03 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPATA17Q96L03 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms