Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN7

RPGRIP1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPGRIP1Q96KN7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPGRIP1Q96KN7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPGRIP1Q96KN7 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms