Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SLC41A2Q96JW4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLC41A2Q96JW4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC41A2Q96JW4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLC41A2Q96JW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms