Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
EAF1Q96JC9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EAF1Q96JC9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms