Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ABCC12Q96J65 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ABCC12Q96J65 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ABCC12Q96J65 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms