Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC10A4Q96EP9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SLC10A4Q96EP9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC10A4Q96EP9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms