Protein–RNA interactions for Protein: Q96E16

SMIM19, Small integral membrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM19Q96E16 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM19Q96E16 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM19Q96E16 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms