Protein–RNA interactions for Protein: Q96CG8

CTHRC1, Collagen triple helix repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTHRC1Q96CG8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CTHRC1Q96CG8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CTHRC1Q96CG8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms