Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHMP4CQ96CF2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CHMP4CQ96CF2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms