Protein–RNA interactions for Protein: Q96C01

FAM136A, Protein FAM136A, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM136AQ96C01 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM136AQ96C01 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
FAM136AQ96C01 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms