Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FAM3DQ96BQ1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM3DQ96BQ1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM3DQ96BQ1 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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