Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMARCE1Q969G3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMARCE1Q969G3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms