Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
BHMTQ93088 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BHMTQ93088 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms