Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTPRN2Q92932 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRN2Q92932 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRN2Q92932 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms