Protein–RNA interactions for Protein: Q92826

HOXB13, Homeobox protein Hox-B13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB13Q92826 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXB13Q92826 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXB13Q92826 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms