Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN4Q92575 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
UBXN4Q92575 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms