Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.3
CTTNBP2Q8WZ74 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC35.62■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CTTNBP2Q8WZ74 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CTTNBP2Q8WZ74 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms