Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CSRNP3Q8WYN3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
CSRNP3Q8WYN3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CSRNP3Q8WYN3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms