Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DNAAF4Q8WXU2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DNAAF4Q8WXU2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms