Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXA3

RUFY2, RUN and FYVE domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY2Q8WXA3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
RUFY2Q8WXA3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
RUFY2Q8WXA3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY2Q8WXA3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY2Q8WXA3 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY2Q8WXA3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RUFY2Q8WXA3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms