Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C1orf54Q8WWF1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
C1orf54Q8WWF1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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