Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVY7

UBLCP1, Ubiquitin-like domain-containing CTD phosphatase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBLCP1Q8WVY7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBLCP1Q8WVY7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBLCP1Q8WVY7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBLCP1Q8WVY7 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms