Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
DCAF4Q8WV16 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DCAF4Q8WV16 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DCAF4Q8WV16 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms