Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU6

GPBAR1, G-protein coupled bile acid receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBAR1Q8TDU6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GPBAR1Q8TDU6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GPBAR1Q8TDU6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GPBAR1Q8TDU6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms