Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BRSK1Q8TDC3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BRSK1Q8TDC3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms