Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD19

NEK9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK9Q8TD19 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NEK9Q8TD19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NEK9Q8TD19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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