Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCW9

PROKR1, Prokineticin receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROKR1Q8TCW9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PROKR1Q8TCW9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PROKR1Q8TCW9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms