Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHU2

CFAP61, Cilia- and flagella-associated protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP61Q8NHU2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CFAP61Q8NHU2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP61Q8NHU2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms