Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HELBQ8NG08 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
HELBQ8NG08 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HELBQ8NG08 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms