Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TMEM229BQ8NBD8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TMEM229BQ8NBD8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms