Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KDM1BQ8NB78 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KDM1BQ8NB78 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms