Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB49

ATP11C, Phospholipid-transporting ATPase IG, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11CQ8NB49 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP11CQ8NB49 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP11CQ8NB49 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms