Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC89Q8N998 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC89Q8N998 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC89Q8N998 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms