Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q9

NIPA2, Magnesium transporter NIPA2, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPA2Q8N8Q9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NIPA2Q8N8Q9 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIPA2Q8N8Q9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPA2Q8N8Q9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPA2Q8N8Q9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPA2Q8N8Q9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIPA2Q8N8Q9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms