Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8P6

Putative uncharacterized protein FLJ39060, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N8P6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8N8P6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8N8P6 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8N8P6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8N8P6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8N8P6 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Q8N8P6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Q8N8P6 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Q8N8P6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Q8N8P6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8N8P6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8N8P6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8N8P6 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8N8P6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Q8N8P6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q8N8P6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q8N8P6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8N8P6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8N8P6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q8N8P6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms