Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPC2Q8N158 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPC2Q8N158 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPC2Q8N158 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms