Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RPAP2Q8IXW5 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RPAP2Q8IXW5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms